33rd Annual Congress of Turkish Pediatric Surgical Association

M Saraç*, EE Önalan**, Ü Bakal*, T Tartar*, A Tektemur**, E Taşkın***, FS Erol****, A Kazez*

*Firat University, Faculty of Medicine, Department of Pediatric Surgery, Elazig, Turkey
**Firat University Medical Faculty Dept. of Pediatric Surgery
***Firat University Medical Faculty Dept. of Pediatrics and Neonatology
****Firat University Medical Faculty Dept. of Neurosurgery

Objective: There are a number of studies about polymorphisms that could be involved in neural tube defect (NTD) pathogenesis of genetic mutations in certain genes that are effective in the process of closure of the neural tube. It is believed that Magnesium is an element which plays an important role in bone development, and genes involved in magnesium homeostasis also lead to NTD etiopathogenesis. In this study the evaluation of TRPM6 polymorphism genotype and allele frequency in NTD patients has been aimed.
Methods: 150 patients admitted a University Hospital, Paediatric Surgery Clinic diagnosed with NTD as patients and the control group subjects were included in the study and 150 children having nearly the same age and sex. From the DNA of the patients polymorphisms of TRPM6 gene rs2274924 (AG; K1579 to; leu1579gl) and Rs3750425 (GA val1393ıl A), were studied using taqman prob 7500 Fast Real-Time System (applied Biosystems, Foster City, CA) and serum magnesium and calcium values of control group and patients were studied.

Results: It is determined that there is a statistically significant difference of   rs2274924 in TRPM6 gene in terms of genotype distributions between patients and controls (p = 0.049) and in patients AA genotype was seen on decrease, yet, heterozygous AG genotype was on the increase. No significant differences in gene Rs3750425 polymorphism genotype in TRPM6 allele distributions were seen when control group was compared to patients. However, in terms of mean serum magnesium levels in the patient group there were significantly differences.  It was determined that for rs3750425 polymorphism, when compared to GG genotype, the serum magnesium levels were statistically significantly higher in genotype polymorphism GA and AA genotype (p = 0.003).

Conclusion: Magnesium deficiency is known to cause intra-uterine growth retardation, malformation and sudden death syndrome. In NTD pathogenesis especially in embryonic development, genetic variants of TRPM6 genes in the regulation of magnesium are believed to play an important role.

M Saraç*, EE Önalan**, Ü Bakal*, T Tartar*, A Tektemur**, E Taşkın***, FS Erol****, A Kazez*

*Fırat Üniversitesi Tıp Fakültesi Çocuk Cerrahisi AD, Elazığ
**Fırat Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji AD
***Fırat Üniversitesi Tıp Fakültesi Çocuk Sağ. Hast. Yenidoğan Bilim Dalı
****Fırat Üniversitesi Tıp Fakültesi Beyin ve Sinir Cerrahisi AD

Amaç: Nöral tüp defekti (NTD)’nin genetik etiyopatogenezinde nöral tüpün kapanma sürecinde etkili olan bazı genlerdeki mutasyon veya polimorfizmlerinde rol alabileceğine dair çalışmalar mevcuttur. Magnezyum kemik gelişiminde önemli rol oynayan bir element olup magnezyum homeostazisinde rol alan genlerin NTD etyopatogeneinde rol alabileceği düşünülmektedir. Çalışmada NTD hastalarında TRPM6 polimorfizm genotip ve allel sıklıklarının değerlendirilmesi amaçlanmıştır.

Metot: Bir Üniversite Hastanesi Çocuk Cerrahisi kliniğine başvuran NTD tanılı 150 hasta ve kontrol grubu olarak yaş ve cinsiyet açısından benzer 150 çocuk  çalışmaya dahil edildi. Hasta DNA’larından TRPM6 genine ait rs2274924 (A˃G; K1579E;Leu1579Glu) ve Rs3750425 (G˃A Val1393Ile) polimorfizmleri, TaqMan probları kullanılarak ABI 7500 Fast Real Time System (Applied Biosystems, Foster City, CA) cihazında çalışıldı. Hastaların ve kontrol grubunun serum magnezyum ve kalsiyum değerleri ölçüldü.

Bulgular: TRPM6 genindeki rs2274924 genotip dağılımları açısından hasta ve kontrol grubu arasında istatistiki olarak anlamlı farlılık olduğu (p=0,049) ve hasta grubunda AA genotipinin azaldığı heterozigot AG genotipinin ise attığı belirlendi. TRPM6 genindeki Rs3750425 polimorfizm genotip ve allel dağılımları açısından kontrol ve hasta gurbu karşılaştırıldığında anlamlı bir farklılık bulunmadı.  Ancak hasta grubunda ortalama serum magnezyum düzeyleri açısından rs3750425 polimorfizim genotiplerine göre anlamlı farklılık bulundu. rs3750425 polimorfizmi için  GG genotipine kıyasla GA ve AA genotipinde serum magnezyum düzeylerinin istatistiki olarak anlamlı düzeyde daha yüksek olduğu  belirlendi (p=0.003).

Sonuç: Magnezyum eksikliğinin intrauterine gelişme geriliği, malformasyon ve ani ölüm sendromlarına neden olduğu bilinmektedir. NTD etyopatogenezinde özellikle embriyonik gelişim sürecinde magnezyum düzenlenmesinde rol oynayan TRPM6 genindeki genetik varyantların rol alabileceği düşünülmektedir.