Poster - 49
Differences in microbiota profiles in simple and complex appendicitis cases and their impact on treatment planning
Lutfiye Öksüz 1, İdil Tunçer 2, Evrim Özdemir 1, Secil Yuksel 2, Başak Erginel 2
1 Istanbul University, Istanbul Faculty of Medicine, Departmant of Microbiology
2 Istanbul University Istanbul Medical Faculty Department of Pediatric Surgery
Aim
Accurate differentiation between simple appendicitis (SA) and complicated appendicitis (CA) is important for appropriate antibiotic therapy. This study aimed to identify the microbial differences between SA and CA using conventional culture methods and microbiota analysis.
Methods
Complete blood counts were obtained from 39 patients who underwent appendectomy and 11 healthy children. Appendix tissue samples and rectal swab specimens were collected from patients who underwent appendectomy, while rectal swab specimens were obtained from the healthy controls. The samples were analyzed using conventional aerobic and anaerobic culture methods in addition to microbiota analysis. Gene sequencing analysis was performed on all specimens to characterize the bacterial communities.
Results
Based on histopathological findings, 16 (41%) patients were classified as having CA and 23 (59%) as having SA. No significant differences in WBC counts or CRP levels were observed between the groups. The most frequently isolated aerobic bacteria were Escherichia spp., Klebsiella spp., and Enterococcus spp. in both groups, whereas the predominant anaerobic bacteria varied according to disease group and specimen type. Compared with the control group, both simple appendicitis tissue (SAT) and complicated appendicitis tissue (CAT) samples showed reduced abundances of the phyla Pseudomonadota and Bacteroidota. Prevotella and Fusobacterium species were more abundant in SAT than in CAT, whereas Porphyromonas and Parvimonas were enriched in CAT. Compared with controls, both simple appendicitis rectal (SAR) and complicated appendicitis rectal (CAR) samples exhibited decreased Bacteroidota and increased Pseudomonadota abundance. Gene sequencing identified Bacillota, Pseudomonadota, and Bacteroidota as the dominant bacterial phyla. Alpha- and beta-diversity analyses showed no statistically significant differences among the tissue and rectal sample groups (p > 0.05).
Conclusion
Complicated appendicitis may have a greater effect on the rectal microbiota than simple appendicitis. The progression from uncomplicated appendicitis to complicated appendicitis may be associated not with a marked change in the overall microbial community of the body, but rather with an increase in certain subtypes of opportunistic and pathogenic microbiota. Rapid microbiota analysis may facilitate differentiation between SA and CA based on characteristic microbial profiles, enabling more targeted antibiotic therapy.
Basit ve komplike apandisit olgularında mikrobiyota profillerindeki farklılıklar ve tedavi planlamasına etkileri
Lutfiye Öksüz 1, İdil Tunçer 2, Evrim Özdemir 1, Secil Yuksel 2, Başak Erginel 2
1 İstanbul Üniversitesi, İstanbul Tıp Fakültesi, Tıbbı Mikrobiyoloji AD
2 İstanbul Üniversitesi İstanbul Tıp Fakültesi Çocuk Cerrahisi AD
Amaç
Basit-komplike olmayan apandisit (BA) ile komplike apandisitin (KA) doğru bir şekilde ayırt edilmesi, uygun antibiyoterapinin
uygulanabilmesi açısından önemlidir. Bu çalışmanın amacı, konvansiyonel kültür ve mikrobiyota analizi kullanarak BA ve KA arasındaki
mikrobiyal farklılıkları belirlemektir.
Yöntemler
Apendektomi yapılan 39 hasta ve 11 sağlıklı çocukların tam kan sayımları bakıldı. Apendektomi yapılan hastalardan
apendiks doku örnekleri ve rektal sürüntü örnekleri alındı. On bir sağlıklı kontrol hastasından rektal sürüntü örnekleri toplandı. Örnekler,
mikrobiyota analizinin yanı sıra konvansiyonel aerobik ve anaerobik kültür yöntemleri ile değerlendirildi. Tüm örneklerde gen dizilimi analizi
yapıldı.
Bulgular
Otuz dokuz hastanın 16'sı (%41), histopatolojik analiz sonuçlarına göre komplike apandisit (KA) olarak, geri kalan 23 (%59) hasta ise basit
apandisit (BA) olarak sınıflandırılmıştır. BA ve KA grupları kendi aralarında karşılaştırıldığında, Wbc ve crp düzeyleri açısından anlamlı bir fark
bulunmamıştır. BA ve KA gruplarında en sık izole edilen aerobik bakteriler Escherichia spp., Klebsiella spp. ve Enterococcus spp. olmuştur. En sık
görülen anaerobik bakteriler ise gruplara ve örnek tiplerine göre farklılık göstermiştir. Kontrol grubuyla karşılaştırıldığında, hem basit
apandisit doku(BAD) hem komplike apandisit doku (KAD) örneklerinde Pseudomonadota ve Bacteroidota filumlarının bolluğunda azalma
gözlenmiştir. Prevotella ve Fusobacterium türleri, BAD örneği grubunda KAD örneği grubuna kıyasla daha baskın bulunmuştur. Buna karşılık,
KAD örneği grubunda Porphyromonas ve Parvimonas cinslerinde belirgin bir zenginleşme saptanmıştır. Kontrol grubuyla karşılaştırıldığında,
hem basit apandisit rektal (BAR) hem de komplike apandisit rektal (KAR) gruplarında Bacteroidota filumunda azalma ve Pseudomonadota
filumunda artış gözlenmiştir. Gen dizileme analizine göre üç ana bakteri filumu belirlenmiştir: Bacillota, Pseudomonadota ve Bacteroidota.
Alfa ve beta çeşitlilik analizleri, doku ve rektal örnekleri grupları arasında anlamlı bir farklılık göstermemiştir (p<0.05).
Sonuç
Komplikasyon durumu, sürüntü örneklerindeki mikrobiyotayı daha belirgin şekilde etkileyebilir. Basit apandisitin, komplike apandisite
ilerlemesi, vücuttaki genel mikrobiyal toplulukta belirgin bir değişikliktense, fırsatçı ve patojen mikrobiyataların bazı alt türlerindeki artış ile ilişkili olabilir.
Mikrobiyota analizi hızlı bir şekilde gerçekleştirilebilirse, artış veya azalma gösteren taksonlara dayanarak BA ile KA ayırt edilebilir ve
antibiyoterapi bu doğrultuda yönlendirilebilir.

